Nació el 19 de marzo de 1831 en Bogotá y murió en la misma ciudad, el 9 de marzo de 1872, en extrema pobreza.

Seudónimos: Areizipa, Un Ingenio de esta Corte.

Estudió en distintos colegios y en el Seminario de la Compañía de Jesús. Diplomático, literato, compilador y editor. Escritor talentoso. Se le considera el iniciador de la crítica literaria en el país por su obra Historia de la literatura neo-granadina (1867).

Con Rafael Pombo redactó el periódico literario y político La Siesta; en Popayán, hacia 1856, con Eustaquio y Francisco Urrutia fundó el periódico político (contra Mariano Ospina), titulado El Sur. En esta misma época de guerra, contra la dictadura militar, se desempeñó como secretario de la Gobernación de la ciudad. En 1860, fue redactor junto con Aníbal Galindo, Ricardo Carrasquilla, José Manuel Marroquín, José Joaquín Borda entre otros, de la segunda época de El Mosaico, y mantuvo la tertulia literaria de este mismo nombre. Mientras estuvo encargado de esta imprenta se publicaron obras muy importantes de poesía y prosa, como fueron los artículos de Emiro Kastos, el primer tomo de las obras de Antonio Nariño, las Confidencias de Lamartine, La lira granadina y otros libros.

También fue redactor en la segunda época de El Heraldo, periódico político (contra Julio Arboleda y Mariano Ospina). Fundador del periódico oficial El Cundinamarqués; de La Unión Católica, y El Entreacto. En 1865, fundó la Revista de Bogotá y se encargó de la clase de retórica del colegio de San Bartolomé. En 1868 fundó el periódico religioso La Fe, junto con Miguel Antonio Caro.

Ocupó varios cargos públicos: Secretario de Hacienda y de Gobierno, en 1854 y 1855, respectivamente, en Popayán. Diputado a la Legislatura del Cauca (1856); jefe político de Popayán y Vicerrector de la Universidad del Cauca. Congresista en 1858 y 1859. Legislador del Estado de Cundinamarca en 1859 y Secretario de Gobierno, en el mismo año. Tesorero de la Casa de Moneda, en 1862. Estuvo en París dos años como secretario de la Embajada colombiana, así como de la legación en Francia e Inglaterra. Fundador de la Academia Colombiana de la Lengua, el 10 de mayo de 1871, y su primer director.

Según el diccionario biográfico y bibliográfico de Joaquín Ospina Vallejo, Vergara

"...tenía un aire muy distinguido, verdaderamente aristocrático, realzado por facciones nobles, por una magnífica barba negra como sus cabellos, abundante y graciosamente rizada y unos ojos tan acariciadores como bellos... Tenía la voz suave pero rápida, precipitada hasta el punto de enredársele frecuentemente muchas palabras..."

José María Samper, su contemporáneo y amigo, también describió los rasgos físicos del autor:

“Era Vergara hombre de talla bastante más que mediana, y vigorosa y correctamente conformado; y no obstante la familiaridad de sus maneras, llanas y afables con todos, y sus instintos y hábitos inofensivamente burlones, tenía un aire muy distinguido, verdaderamente aristocrático, realzado por facciones nobles pero de suaves lineamientos, por una magnífica barba, negra como sus cabellos, abundante y graciosamente rizada, y unos ojos tan acariciadores como bellos”.

Según el mismo Vergara en sus apuntes autobiográficos escribió con mucho humor que él tenía algunas obras “manuscritas: Mercedes, novela. Cuadros Políticos o Días Históricos, desde 1849. Parte del diccionario geográfico; casi todo el diccionario biográfico. Andando, dos novelas: Un Chismoso y Un odio a muerte. Discurso sobre la generación del lenguaje; y otras barbaridades que tengo guardadas”.

Autor de la obra El espíritu del siglo. Drama escrito en pluma y corregido con lápiz. En un prólogo y un acto, escrita en 1855 y publicada en Bogotá (1864, 1896, 1989). Esta obra se sale de los moldes dramáticos de la época, se burla especialmente del melodrama que en este momento tenía gran aceptación.