Nació en Medellín, el 21 de septiembre de 1951.

Cuentista, artista plástico, guionista, comediógrafo. Fundador del grupo de teatro El Águila Descalza (Medellín), en 1980. Este nombre lo tomó Aguirre de la inscripción que estaba escrita en unos cauchos traseros que tenía una volqueta transportadora de arena.

Realizó estudios de Literatura en la Universidad de Antioquia (1972-1985).

Desde niño, Aguirre declamaba gracias a su madre y a la herencia recibida del abuelo, quien había organizado un grupo teatral de aficionados en Anorí (Antioquia). Se inició en el teatro en 1972, época en que empezó a pertenecer a varios grupos, tales como: El Taller de la Universidad de Antioquia; Títeres La Polilla, dirigido por Alberto Llerena; el Taller de Artes, dirigido por Samuel Vásquez, y La Fanfarria, dirigido por José Manuel Freidel.

Durante su formación teatral realizó cursos y talleres con Amaría Pellegrín, Mirka Stratigoupoulos, Luis Bacalov, Jerzy Grotowsky, Danilo Tenorio, Enrique Buenaventura, Silvia Rollz, entre otros maestros.

Aguirre fue finalista del Concurso Nacional de Cuentos Julio Vives Guerra, con el cuento titulado Atusingatesa pita pita salió para el mercado o De cómo me quedo callado bajo el sol de mi pueblo. Coautor de los guiones para televisión (52 capítulos), del seriado País paisa, emitido por Teleantioquia, en 1990.

Participó en la creación de la Escuela de Artes Representativas de la Universidad de Antioquia, en 1975, donde fue profesor. En la primera etapa, entre 1980 y 1984, Aguirre dirigió obras de su propia creación y de otros autores, tales como, Mima mame mima; Corporizaciones para después de cenar, obra de mimo y pantomima; El pupilo que quiso ser tutor, de Peter Handke; El sueño de las escalinatas, de Jorge Zalamea Borda; Medellín, a solas contigo, de Gonzalo Arango; La cantante calva, de Eugenio Ionesco, y El canto del cisne, de Antón Chéjov. Asimismo, Aguirre fue autor y actor de otras adaptaciones teatrales estrenadas en Medellín: Matando el tiempo (1999), versión teatral del cuento El pelaíto que no duró nada, del cineasta Víctor Gaviria, que narra la historia de uno de los actores de la película Rodrigo D. no futuro, quien muere tempranamente. Esta obra fue ganadora de la Beca de Creación del Festival Iberoamericano de Teatro. 2000.Filomena la vaca filomenal, obra para títeres.

En 1984, consiguió una pequeña sede donde estrena la obra de su autoría Tanto tango, monólogo en el que la música sirve de texto a la cultura de barriada de Medellín. Este es el inició de su dramaturgia en la cual los elementos populares comienzan a ser protagonistas de todas sus obras. Por ejemplo, La novena del niño Dios.

En el Magazín Dominical de El Colombiano (marzo 10, 1985), una nota escrita por Rodrigo Zuluaga, en uno de sus párrafos escribió:

“El Águila Descalza es el nombre de este grupo de teatro conformado por un solo actor, que se ha especializado como tantos otros en el teatro unipersonal, por una imposibilidad harto inconveniente de trabajar en equipo. Tratando de establecerse en una sede que le permitiera una labor continua y sistemática se estableció en este pequeño lugar y ha hecho desde el mes de junio y hasta diciembre, 120 representaciones teatrales, interpretando cada vez cinco, seis y más papeles con la facilidad y propiedad de quien conoce y maneja las herramientas del oficio actoral”.

Al año siguiente, en una nueva casa, en el Parque de Laurales, y en un espacio un poco más amplio, estrena El sueño del Pibe (1985), montaje unipersonal, actuado y dirigido por Aguirre, basado en la obra Muro de contención, del brasileño Carlos Queiroz, que trata sobre un albañil que sueña ser futbolista, y que hace y deshace un muro mientras el Atlético Nacional (equipo de Medellín) pierde. En este año lo empieza a acompañar la actriz Cristina Toro en la actuación y en la creación de textos. Ambos conforman la base de la agrupación El Águila Descalza.

Autor (junto a Cristina Toro), actor y director de las piezas: Boleros en su ruta, estrenada en 1985, que trata sobre el amor de las radionovelas, sobre declaraciones amorosas en heladerías y fiestas a través de letras de canciones. Según Aguirre, con País paisa (1986), su dramaturgia se consolida y continúa explorando esta veta popular, dado que noche tras noche los teatros de gran capacidad de aforo, donde se presentan, agotan la boletería, no solo en Medellín sino en distintas ciudades del país, como Bogotá, donde estuvo en temporada durante ocho meses continuos, e inicia gira en el exterior, en ciudades como Miami y Nueva York.

Aguirre continúa en la exploración de una dramaturgia que integre personajes populares en situaciones de la vida cotidiana de una pareja, de una familia o de un barrio, entre otros. El siguiente estreno lo tituló Medio Medellín (1989); durante la temporada de estreno de 1989 esta pieza estuvo en cartelera con el título: Pues Antioquia, vos y medio Medellín; Chicos malos, S.A. (1992); Trapitos al sol (1992), que trata con humor la historia de una pareja después de diez años de matrimonio: celos, infidelidades, cantaletas, reclamos. Esta obra obtuvo cuatro nominaciones a los premios de la Asociación de Críticos y Comentaristas de Arte, Miami, 1944, a mejor obra, mejor director, Carlos Mario Aguirre; mejor actor, Carlos Mario Aguirre; mejor actriz, Cristina Toro. Las siguientes obras se titulan Colcha de retazos (1994), estrenada en 1995, presenta diversas escenas cotidianas de una urbe; Pecao mortal; Vida de perros (1996); Cosas de la vida (1997); La patria boba (1999).

En una nueva sede, que la agrupación inauguró con el patrocinio del Ministerio de Cultura, logró tener una sala más amplia, en la cual mantiene temporadas permanentes e invitar a otras agrupaciones artísticas.

Coautor y actor de los DVD: País paisa, País paisa Recargado, Mañana le pago, Trapitos al sol, Va la madre, Coma callao, Chupe por bobo, La patria boba, El sueño del Pibe, Colcha de retazos, No vuelvo a beber, Cosas de la vida, La puntica no más, Tanto tango, Vida de perros, Historia clínica y Lo que no mata, engorda – Bandeja Paisa.  

Actor y productor de las películas Cuidados intensivos (Medellín, 2014) y Todos los hombres son iguales y las mujeres también (Medellín, 2004), producción inédita.

Otras obras de teatro son: Matando el tiempo (2000); Historia clínica (2001); Su Mamá... ¡la suya! (2002); San Gardel de Medellín (2003); Ambiente familiar con cantaleta (2004); Llevando del bulto (2005); ¡Va la madre! (2006); Mañana le pago (2006); Coma callao (2008); Chupe por bobo (2009); No vuelvo a beber (2011); Vida de perros, maluco también es bueno (2014); La puntica no más (2015); Gringolombia (2017). Bandeja paisa, Lo que no mata, engorda (2018); Coronavirus, una obra viral (2021); Luna de mier... (2022), y Clase mela.

Como artista plástico, Aguirre cuenta con una extensa producción de óleos, dibujos y collages, parte de los cuales están exhibidos en el Museo Teatro Prado del Águila Descalza. También ha participado en exposiciones colectivas en el Museo El Castillo, en la Casa Museo Pedro Nel Gómez, en el Museo de Antropología y Artes de Jericó Antioquia – MAJA, en la exposición El objeto deseo del tiempo (2023), y en la exposición individual Ahí está pintado, en la Galería Naranjo Velilla.

¡Mucha gracia! El Águila Descalza. 1980-2020, es el libro que recoge la historia de la agrupación, compuesto de dos tomos. La edición está ilustrada. Fue presentado al público en 2021, durante La Fiesta del Libro, de Medellín

A lo largo de su carrera, tanto la agrupación como Aguirre han recibido premios y distinciones, entre ellos los siguientes: Orden Turantioquia, 1987; Orden Porfirio Barba Jacob, 1989, en la categoría Oro, Municipio de Medellín. Orden Pedro Justo Berrío, 1989, categoría Oro, Gobernación de Antioquia. Escudo de Oro 1989, Universidad de Antioquia. Chibcha de Oro 1989, New York. Orden de la Democracia, Categoría de Comendador, Cámara de Representantes, octubre de 2000. Homenaje por su trayectoria teatral en el marco de la celebración de la Semana Internacional del Teatro, realizado por el Teatro Porfirio Barba Jacob (Medellín, 2019). Placa de reconocimiento por su trayectoria teatral, en el marco de la celebración de la Semana Internacional del Teatro, realizado por el Teatro Pablo Tobón Uribe (Medellín, 2019). Mercurio de Oro, máximo galardón concedido por Fenalco Antioquia, en la Noche de los Mejores (Medellín, 2021); entre otros reconocimientos y homenajes